Воскресная школа при Свято-Пафнутьевом монастыре действует с 2000 года. В 2013-2014 учебном году в школе обучается более 80 детей в возрасте от 5 до 16 лет в пяти возрастных группах и около 60 детей, посещающих занятия не регулярно.

Духовным наставником детско-юношеской воскресной школы является иеромонах Лазарь (Антипенко).